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\footnotesize En las distribuciones Beta $Beta(\alpha,\beta)$, $\alpha$ y $\beta$ son parámetros de forma, mientras que en las distribuciones uniformes $U(a,b)$, $a$ y $b$ son los valores mínimo y máximo.
  
 
El resultado de la inferencia Bayesiana es la llamada ''distribución  a posteriori'', por el teorema de Bayes la distribución a posteriori esta definida por ([[#eq-17|17]]):
 
El resultado de la inferencia Bayesiana es la llamada ''distribución  a posteriori'', por el teorema de Bayes la distribución a posteriori esta definida por ([[#eq-17|17]]):

Revision as of 17:05, 18 October 2024

1 Introducción

La fiebre chikungunya es una enfermedad viral transmitida a los humanos por mosquitos del género Aedes [1]. El virus, que da nombre a la enfermedad, se describió en humanos por primera vez en 1952 en Tanzania, África, donde entre el 60% y el 80% de la población presentó síntomas de artralgia, fiebre y erupciones cutáneas. Muchas personas, tras el periodo agudo de la enfermedad, continuaron experimentando dolores articulares durante meses [2].

Entre 1960 y 1990, hubo brotes de fiebre chikungunya en varios países africanos, como República Democrática del Congo, Uganda, Angola, Sudáfrica y Nigeria [3]. En América, el primer caso se reportó en la isla de San Martín ubicada en el Caribe} en 2013, y para diciembre de 2014, la enfermedad se había extendido a 17 países sudamericanos. Actualmente, se ha identificado en 45 países en el Caribe, América del Norte, América del Sur y América Central [3].

En México, el primer caso importado de fiebre chikungunya se presentó en mayo de 2014 [4]. A finales de ese año, se reportaron 155 casos en los estados de Chiapas, Guerrero, Oaxaca, Sonora y Sinaloa. Para la semana epidemiológica 40, en 2015 se habían contabilizado 8,668 casos confirmados, siendo Guerrero el estado con la mayor cantidad de infectados, con el 18.38% [5]. Al final de ese año, se confirmaron un total de 12,588 casos de chikungunya en México [6].

Cuando una persona es picada por un mosquito infectado, los síntomas suelen comenzar entre 3 y 7 días después del período de incubación. Durante este tiempo, el virus se multiplica en el organismo del infectado, pero la persona no presenta síntomas ni es contagiosa para otros. Los síntomas incluyen dolor intenso en las articulaciones, fiebre superior a 39°C, dolor muscular y, ocasionalmente, náuseas, vómitos y erupciones cutáneas. El dolor articular puede ser tan intenso que resulta debilitante o incapacitante [2]. Tras una semana, la mayoría de los pacientes experimenta una notable mejora: la fiebre, el cansancio y la artralgia disminuyen significativamente en 1 o 2 semanas, aunque frecuentemente se produce una recaída [7]. Actualmente, no existe un tratamiento específico para la infección por chikungunya; el manejo se limita a aliviar los síntomas con medicación analgésica y antiinflamatoria [2].

Se ha reportado el fenómeno de recaída en las infecciones por chikungunya [8,9,10]. La recaída se define como la reaparición de artralgia debido a la persistencia del virus en las células del tejido musculoesquelético después de un período sin síntomas de al menos una semana [8] o después de un mes [10]. En un estudio de cohortes realizado en Francia, basado en datos de un sistema de vigilancia de laboratorio, se confirmó la infección inicial mediante una prueba de anticuerpos o PCR (reacción en cadena de la polimerasa). En ese estudio, se reportaron recaídas de artralgia en el 72% de los pacientes; el número promedio de recaídas fue de 4 y el tiempo promedio entre dos recaídas fue de 8 semanas [8]. Por otro lado, un estudio transversal realizado en Acapulco, Guerrero, en diciembre de 2015, encontró que el 66% de la población (3,531 de 5,870 personas) autoreportó haber estado infectada; el 31.1% de las personas que sufrieron chikungunya (1,098 de 3,531) reportaron al menos una recaída después de un mes de recuperarse de la enfermedad. De estos, el 13% experimentó una recaída, el 12% tuvo dos recaídas, el 4% reportó tres recaídas y solo el 2% mencionó más de cuatro recaídas [10].

La edad como factor de riesgo es común en las enfermedades infecciosas transmitidas por vectores. En el caso del chikungunya, un estudio de seropositividad reportó la frecuencia de positivos al virus en los siguientes grupos etarios: 33% en el grupo de 0 a 19 años, 62% en el de 20 a 39 años, 67.4% en el de 40 a 49 años, 75% en el de 50 a 59 años, 59% en el de 60 a 69 años, 25% en el de 70 a 79 años y 33% en el de 80 años y más [11], lo que muestra una variabilidad en la susceptibilidad al virus.

La variabilidad en el período de recaídas y en la susceptibilidad al virus del chikungunya motivó a Vázquez-Peña, Vargas-De-León y Velázquez-Castro [12] a desarrollar un modelo hospedero-vector que considera tanto la edad cronológica como la edad de la infección asintomática. Este modelo se presentará en la Sección 2.

A partir de este modelo hospedero-vector con dos estructuras de edad, obtendremos un modelo en ecuaciones diferenciales ordinarias para el virus del chikungunya, tal como fue propuesto por Vázquez-Peña et al. [13], el cual se discutirá en la Sección 3.

En este trabajo, se propone estimar los parámetros y el número reproductivo básico utilizando un enfoque Bayesiano con los datos del brote de chikungunya en Acapulco, Guerrero [10]. Para ello, emplearemos el modelo hospedero-vector presentado en la Sección 3. La metodología del enfoque Bayesiano se describirá en la Sección 4, mientras que la estimación Bayesiana de los parámetros y del número reproductivo básico (12) se presentará en la Sección 5. Finalmente, en la Sección 6, se realizarán algunos comentarios finales.

2 Modelo hospedero-vector con dos estructura de edades

Denotamos por y $ el número total de hospederos y vectores, respectivamente. Las poblaciones de hospederos y vectores se dividen en clases disjuntas según su estado epidemiológico. Para los hospederos, consideramos cuatro grupos: susceptibles (), infectados (), asintomáticos () y recuperados (). En contraste, los vectores se dividen únicamente en susceptibles () e infectados ().

La edad cronológica se denota por , de manera que representa la cantidad de hospederos susceptibles con edad cronológica en el tiempo . Entonces, el total de hospederos susceptibles está dado por


(1)

Suponemos que la probabilidad de transmisión del vector al hospedero depende de la edad del hospedero, lo cual se denota por .


La tasa de transmisión del vector infectado al hospedero susceptible está definida por , donde es el promedio de picaduras por unidad de tiempo y representa el número promedio de picaduras por unidad de tiempo por cada hospedero. Esto significa que se está distribuyendo el número total de picaduras entre el total de hospedero. Al mismo tiempo, la clase de hospederos susceptibles disminuye debido a la muerte natural a una tasa y a alguna estrategia de prevención, como la vacunación, enfocada únicamente a ciertos grupos de edad, la cual será modelada por el parámetro . Por lo tanto, definimos .

Bajo estas hipótesis, se formula la primera ecuación del modelo:

Suponemos que todos los individuos nacen susceptibles a una tasa , de manera que obtenemos la condición de frontera:

Una vez que un hospedero se ha infectado, permanece en dicha clase hasta que los síntomas desaparecen a una tasa o por muerte por causas naturales a una tasa . Consideramos que una fracción no se recuperará y pasará a la fase asintomática durante un tiempo , que representa la edad de la infección asintomática. La clase de hospederos asintomáticos se representa por , donde

(2)

es el total de hospederos asintomáticos. Además, la tasa en que los síntomas de la enfermedad vuelven a manifestarse depende de la edad de la infección asintomática; por ende, los hospederos asintomáticos retornan a la clase de hospederos infectados en un tiempo . Con esto, se propone la segunda ecuación del modelo.

La clase de hospederos asintomáticos se reduce cuando los síntomas vuelven a manifestarse o por muerte por causas naturales, lo que da lugar a la siguiente ecuación del modelo:

Los hospederos infectados entran en la clase asintomática a una tasa , comenzando el conteo de la edad de la infección asintomática, lo que se traduce en la condición de frontera

Los hospederos infectados se recuperan de manera permanente a una tasa y permanecen en esa clase hasta la muerte por causas naturales a una tasa , lo que se representa en la cuarta ecuación diferencial del modelo

En cuanto a los vectores, suponemos que nacen y mueren a la misma tasa . Un vector nace susceptible y se infecta al picar a una persona con el virus, ya sea un hospedador infectado o un hospedador asintomático. De manera análoga al caso de los hospedadores, la tasa de transmisión depende de la probabilidad de que el contacto entre un hospedador infectado y un vector susceptible sea efectivo. Esta probabilidad se modela con el producto de la probabilidad de transmisión del virus y el número promedio de picaduras por unidad de tiempo por cada hospedero . Adicionalmente, se introduce el parámetro para tener en cuenta que la probabilidad de transmisión de un hospedero infectado a un vector es mayor que la tasa de transmisión de un hospedero asintomático a un vector. Por lo tanto, se considera que . Bajo estas suposiciones, obtenemos la quinta ecuación del modelo:


Después de que el vector se infecta de la forma descrita, permanece en esa clase hasta morir, lo que se modela en la última ecuación del modelo:

Por lo que se obtiene el siguiente sistema integro-diferencial recientemente propuesto por Vázquez-Peña, Vargas-De-León y Velázquez-Castro para el virus de chikungunya [12].

(3)

Si consideramos que el tamaño de la población de vectores se mantiene constante en el tiempo, , y observamos que la variable no esta acoplada en las demás ecuaciones, el modelo se reduce a

(4)

Las condiciones iniciales están dadas por

Donde y representan la distribución inicial de los huéspedes susceptibles y de los hospederos asintomáticos con edad cronológica y edad de infección asintomática, respectivamente. e son el número inicial de hospederos y de vectores infectados, respectivamente.

2.1 Propiedades del sistema

El número reproductivo básico para el modelo (4) fue obtenido en [12]

(5)

donde está dada por

(6)

y por

(7)

El punto de equilibrio libre de la enfermedad del sistema integro-diferencial (4) se obtiene al considerar , e iguales a cero simultáneamente, lo que resulta en , donde

(8)

En [12], se utiliza una estrategia geométrica para demostrar la existencia del punto de equilibrio endémico cuando .

Las propiedades de las soluciones a tiempos largos se resumen en el siguiente teorema:

Teorema 1: (Ver [12])

i) Si , el punto de equilibrio libre de la enfermedad del sistema integro-diferencial (4) es global asintóticamente estable.

ii) Si , existe un único punto de equilibrio endémico del sistema (4) y es global asintóticamente estable.


El ítem i) del Teorema 1 se demostró utilizando el segundo método de Lyapunov. Se construyó el siguiente funcional de Lyapunov , que es una combinación de una funcional tipo Volterra y funcionales lineales

donde es la siguiente función auxiliar:

(9)

para todo .

El ítem ii) del Teorema 1 se demostró usando una funcional de Lyapunov , que es una combinación de funcionales tipo Volterra , definida por

donde es la siguiente función auxiliar:

para todo .

La estrategia de construcción de funcionales de Lyapunov tipo Volterra ha sido ampliamente utilizada en epidemiología matemática [14,15,16,17,18,19,20].

3 Modelo hospedero-vector independientemente de las edades

Usando las siguientes tranformaciones (1) y (2) donde es el total de hospederos susceptibles de cualquier edad cronológica y es el total de hospederos asintomáticos con cualquier edad de la infección asintomática. Además, para simplificar la complejidad del modelo, proponemos que las funciones dependientes de la edad se definan como constantes: , , y . Al integrar la primera ecuación del sistema (3) con respecto de y la cuarta ecuación de (3) con respecto de utilizando las respectivas condiciones de frontera, el sistema integro-diferencial (3) se reduce a un modelo en ecuaciones diferenciales ordinarias para el virus de chikungunya que ha sido estudiado por Vázquez-Peña et al. [13].

(10)


Considerando ambas poblaciones constantes y el sistema se reduce a

(11)

Las condiciones iniciales del sistema (11) están dadas por

Donde e no son cero simultáneamente.

La región factible de las soluciones del modelo (11) es

3.1 Número reproductivo básico

Para calcular el número reproductivo básico, Vázquez-Peña et al. [13] utilizaron el método de la matriz de la siguiente generación [21]. Separaron las ecuaciones en , que contiene los términos asociados a nuevas infecciones, y , que incluye los términos de transiciones individuales en cada clase, es decir,

y

Tras calcular las matrices Jacobianas de y y evaluarlas en el punto de equilibrio libre de la enfermedad se obtienen, respectivamente, una matriz no negativa y una -matriz .

Entonces, el número reproductivo básico está dado por el radio espectral de la matriz , es decir

(12)

donde

(13)

denota el número promedio de casos secundarios que produce un individuo infectado al introducirlo a una población totalmente susceptible. Esto se puede entender de la siguiente manera: un mosquito infectado distribuye picaduras en la población humana durante el resto de su vida, y una proporción de estas picaduras se convierte en nuevas infecciones. Por otro lado, el número de nuevas infecciones en los mosquitos por parte de hospederos infectados y asintomáticos durante el periodo infeccioso está dado por , respectivamente. La media geométrica de estas dos cantidades, que es igual a , proporciona el número promedio de infecciones secundarias. En el contexto de enfermedades transmitidas por vectores, como el chikungunya, un sugiere que la enfermedad se propagará en la población, mientras que un indica que la enfermedad eventualmente se extinguirá.

3.2 Puntos de equilibrio y su estabilidad global

Además del punto de equilibrio libre de la enfermedad , el modelo (11) tiene un punto de equilibrio endémico , con

(14)

Dado que el sistema (11) es un caso particular del sistema integro-diferencial (4), obtenemos el siguiente corolario derivado del Teorema 1.

Corolario 1: i) Cuando entonces el punto de equilibrio libre de la enfermedad del sistema (11) es global asintóticamente estable. ii) Cuando entonces el punto de equilibrio endémico del sistema (11) es global asintóticamente estable.

4 Estimación Bayesiana

4.1 Brote de chikungunya en Acapulco

En 2015, Acapulco, Guerrero, experimentó un brote de chikungunya. En [10] se realizó un estudio transversal para caracterizar dicho brote epidémico, que incluyó encuestas en 1,305 viviendas distribuidas en ocho conglomerados urbanos considerados representativos de Acapulco. En total, se administraron 5,870 cuestionarios, identificando 3,531 casos de chikungunya entre enero y diciembre de 2015. Para asegurar la representatividad en el estudio [10], se realizó un muestreo intencional que buscaba reflejar las condiciones urbanas promedio de Acapulco, lo cual es clave en contextos donde no se puede utilizar un muestreo probabilístico.

Para reducir el impacto de las fluctuaciones aleatorias o ruido en los datos reportados de los casos de chikungunya [10], se aplica el método de suavizamiento exponencial:

donde es el pronóstico de casos de chikungunya para el tiempo de la serie de tiempo, donde representa el valor observado de casos de chikungunya en el tiempo , es el pronóstico de casos de chikungunya para el tiempo , y es la constante de suavizamiento (). Se supone que el pronóstico inicial de casos de chikungunya es igual al primer valor observado . Con el suavizado, logramos obtener valores con menor variabilidad, lo que permite observar mejor la evolución de la serie temporal. La estimación Bayesiana se realizará con .

Utilizando los datos recabados por [10] sobre los casos mensuales autoinformados de chikungunya y el método de suavizamiento exponencial con un valor de , se ajustará la curva de los humanos infectados $I_h$ para estimar de manera puntual y por intervalo los parámetros y el número reproductivo básico (12) del modelo (11).

4.2 Modelo estadístico

Para , el vector de observaciones del número de humanos infectados () en el tiempo , considere el siguiente modelo estadístico:

(15)

donde:

  • es el número de humanos infectados () en el tiempo .
  • es vector de parámetros en la estimación Bayesiana.
  • es la solución numérica del modelo (11) con el método . En este caso se usó el método numérico de Runge-Kutta de orden 4.
  • es el error aleatorio en el tiempo , los errores son independientes para cada tiempo, normalmente distribuidos con media cero y varianza .

4.3 Función de verosimilitud

Considerando el supuesto de normalidad para el error aleatorio , entonces se tiene que . Por tal razón, la función de verosimilitud está dada por la ecuación (16):

(16)

4.4 Distribución a priori y a posteriori

La estadística Bayesiana permite al investigador incorporar conocimiento de los parámetros al proceso de inferencia. Esta información se especifica por medio de una distribución a priori () y puede restringir la inferencia a un rango de interés y asignar mayor probabilidad a un subconjunto de valores. Esto permite enfocarse en los rangos plausibles según el conocimiento de la literatura o la definición del parámetro en el modelo matemático. Por ejemplo, la probabilidad de transmisión de vector a humano está definida en el intervalo . Dado que se trata de una probabilidad, es conveniente utilizar o definir distribuciones a priori con soporte en este mismo intervalo, como la distribución uniforme o la distribución Beta , entre otras. Para proponer la distribución a priori de se consultaron en la literatura los valores que se han reportado y se muestran en la Tabla 1.


Tabla. 1 Distribuciones a priori seleccionadas con base en los valores reportados en la literatura.
Parámetro Descripción Referencia Valor medio o rango de valores Distribución a priori
Probabilidad de transmisión de vector a humano [22] 0.99 [0.6,1]
[23] 0.37
[24] [0.5, 0.8]
[25] 0.67 [0.26, 1]
Probabilidad de transmisión de humano a vector [22] 0.6 [0.6,1]
[23] 0.375
[24] 0.37
Número de picaduras [22] 2.46 [1,3]
[23] 1
[24] 0.5 or 1
Tasa de muerte y nacimiento de vectores [23] 2.72
[24] 4.28
[26] 2.14
Tasa de recuperación [22] [3.7,4.5]
[26] [2,6]
Fracción de infectados que se vuelven asintomáticos Supuesto
Tasa de recaída [8] 0.5
[10] 0.66
Fracción de transmisión de humano asintomático a vector Supuesto
Número total de vectores Supuesto 2 a 4.5 veces el número total de humanos
Tasa de muerte y nacimiento de humanos [27] Valor fijo
Número total de humanos [10] 5870 Valor fijo


\footnotesize En las distribuciones Beta $Beta(\alpha,\beta)$, $\alpha$ y $\beta$ son parámetros de forma, mientras que en las distribuciones uniformes $U(a,b)$, $a$ y $b$ son los valores mínimo y máximo.

El resultado de la inferencia Bayesiana es la llamada distribución a posteriori, por el teorema de Bayes la distribución a posteriori esta definida por (17):

(19)

donde

  • es la probabilidad a posteriori de dada un conjunto de observaciones .
  • es la probabilidad de las observaciones para un valor específico del vector .
  • distribución a priori.
  • es un constante de normalización .

Note que la expresión (17) esta bien definida si . es constante, por tanto podemos reescribir (17) como (18):

(20)

En el proceso de inferencia, el objetivo es obtener analíticamente el valor medio de la distribución posterior de los parámetros. Para ello, es necesario marginalizar dicha distribución a posteriori.

(21)

Sin embargo, en la gran mayoría de los casos, la integral de la marginalización (19) no puede resolverse de forma analítica debido a la alta dimensionalidad de . En la práctica, se utiliza el método de Markov Chain Monte Carlo (MCMC) para realizar un muestreo aproximado de los elementos que conforman el vector de parámetros [28]. El MCMC emplea muestreadores como el algoritmo de Metropolis-Hastings, el algoritmo t-walk, el muestreador de Gibbs y el Hamiltoniano Monte Carlo (HMC).

El método MCMC construye una cadena de Markov a partir de los valores muestreados. Cada estado de la cadena corresponde a un valor de la distribución objetivo, y cada iteración del muestreo genera un nuevo estado que depende del estado anterior. Este proceso estocástico iterativo se continúa hasta que la cadena muestra convergencia. Es común que durante un período inicial los valores muestreados estén alejados del valor verdadero, por lo que se recomienda descartar este período inicial. A este período se le conoce como “periodo de quemado”.

Una vez obtenida la muestra de los parámetros de interés, para realizar inferencias se utiliza el estimador de Bayes , definido como la solución de 20.

(22)

con la función de pérdida cuadrática, se obtiene el mínimo en , es decir el estimador obtenido es el valor medio . Utilizamos este estimador para hacer inferencias en las densidades a posteriori.

Para la estimación por intervalo se utilizó el método de intervalos de alta densidad a posteriori (HPD, por sus siglas en inglés Highest Posterior Density). Se prefieren los intervalos HPD sobre el método de percentiles debido a que los HPD son los intervalos de menor longitud entre todos los posibles intervalos de probabilidad para un nivel de credibilidad deseado.

4.5 Método Hamiltoniano de Monte Carlo

El método de Hamiltoniano Monte Carlo (HMC) ha demostrado ser un muestreador más eficiente que los tradicionales. Su tasa de aceptación es aproximadamente el doble de la tasa de aceptación del algoritmo de Metropolis-Hastings [29]. Esta técnica de muestreo se basa en la mecánica Hamiltoniana para explorar distribuciones de alta dimensionalidad. El estudio detallado de esta técnica avanzada está fuera del alcance de este trabajo; para una comprensión más profunda de HMC, se recomienda consultar el trabajo de Betancourt [30].

4.6 Convergencia de Cadenas

  • Método de inspección visual: Este método se basa en la observación empírica de las cadenas de Markov para verificar que sus trazas estén adecuadamente mezcladas. Es común que esta mezcla produzca visualmente una figura similar a una “oruga”.
  • Diagnóstico de Gelman-Rubin: Este diagnóstico es uno de los más populares para determinar la convergencia de las cadenas de Markov. Se basa en comparar la varianza dentro de las cadenas con la varianza entre cadenas utilizando el cociente [31]. En la práctica, se considera que las cadenas convergen si , mientras que si , al menos una de las cadenas aún no ha convergido.

4.7 Software estadístico

En este trabajo se utilizó el lenguaje de programación Julia [32] con el paquete de análisis Bayesiano Turing.jl [33] para estimar los parámetros. Se ejecutaron tres cadenas de Markov, cada una inicializada de manera aleatoria y con 20,000 iteraciones. Las primeras 1,000 iteraciones de cada cadena se descartaron como periodo de quemado, resultando en una muestra final de 19,000 valores por cadena. El diagnóstico de convergencia de Gelman-Rubin se realizó por defecto utilizando el paquete Turing.

Se utilizo la paquetería MCMChains.jl [34] para estimar los intervalos de HPD al 95%

5 Resultados

En la Tabla 2, se presentan los resultados de la estimación Bayesiana para los parámetros del modelo, así como para el número reproductivo básico . La Tabla 2 muestra los valores de media, mediana, intervalos de HPD del 95% y los valores de Rhat para cada parámetro.

Las probabilidades de transmisión de vector a humano y de humano a vector tienen medias de 0.72 y 0.75, respectivamente, con intervalos de credibilidad del 95% de (0.46, 0.97) y (0.49, 0.98). Esto representa probabilidades altas de transmisión.

El promedio del número de picaduras de los vectores es de 3.13, con un intervalo de credibilidad del 95% de (2.29, 4.00). La media de la tasa de muerte y nacimiento de vectores es de 3.41 , con un intervalo de credibilidad del 95% de (2.08, 4.44), lo que equivale a un periodo de vida de los vectores de 6.7 a 14.4 . Se estima una media del número total de vectores de 19,18, con un intervalo de credibilidad del 95% de (12,58, 26,35).

La tasa de recuperación tiene una media de 4.44, con un intervalo de credibilidad del 95% de (2.50, 6.63), lo que corresponde a un periodo de recuperación de 4.5 a 12 . La tasa de recaídas muestra una media de 0.75 , con un intervalo de credibilidad del 95% de (0.38, 1.00), lo que equivale a un periodo de recaída de 30 a 77.7 .

La media de la fracción de infectados que se vuelven asintomáticos es 0.65, con un intervalo de credibilidad del 95% que varía entre una fracción baja de 0.41 y una alta de 0.84. La media de la fracción de transmisión de humano asintomático a vector es 0.24, con un intervalo de credibilidad del 95% de (0.01, 0.52), que va de una fracción casi nula a moderada.


Modelo ajustado usando la media como estimador puntual. Draft Vargas-De-Leon 400593385-ajusteSIAI.png
(1) Modelo ajustado usando la media como estimador puntual.

Finalmente, el número reproductivo básico fue de 2.61, con un intervalo de credibilidad del 95% de (1.66, 3.80). En [35] estiman que el es de 4.1 (intervalo de confianza del 95% de 1.5 a 6.6) para los vectores Aedes aegypti, lo que sugiere que el chikungunya podría propagarse rápidamente. Nuestras estimaciones son consistentes con lo publicado en [35].

En la Tabla 2 los valores de son menores a 1.1, por lo cual todas las cadenas presentadas son convergentes. Las trazas de los parámetros se muestran en la Tabla 3.

En la Figura 1 se muestra el ajuste del modelo a la curva de humanos infectados con chikungunya, así como la simulación de las cuatro clases: hospederos susceptibles , hospederos infectados , hospederos asintomáticos y vectores infectados . Los puntos sólidos representan los datos obtenidos por [10] que se han suavizado por el modelo de suavizamiento exponencial con .


Tabla. 2 Resultados de la estimación Bayesiana.
Parámetro Media Mediana Intervalos de HPD del 95% Rhat
0.72 0.74 (0.46, 0.97) 1.00
0.75 0.76 (0.49, 0.98) 1.00
3.13 3.15 (2.29, 4.00) 1.00
3.42 3.49 (2.08, 4.44) 1.00
4.44 4.32 (2.50, 6.63) 1.00
0.65 0.66 (0.41, 0.84) 1.00
0.75 0.79 (0.38, 1.00) 1.00
0.24 0.21 (0.01, 0.52) 1.00
19183 19179 (12589, 26358) 1.00
2.61 2.46 (1.66, 3.80) 1.00


Tabla. 3 A la izquierda, se muestran las trazas, y a la derecha, las distribuciones a posteriori de los parámetros del modelo hospedero-vector para chikungunya (11).
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Draft Vargas-De-Leon 400593385-densitysigmavar.png

6 Conclusiones

En este trabajo, presentamos una revisión de modelos recientemente desarrollados para el virus del chikungunya. Uno de estos modelos incorpora dos estructuras de edad, mientras que el otro es un caso particular, independiente de la edad. Para este último modelo, se estimó el número reproductivo básico del brote de chikungunya en Acapulco, con el que alcanzamos el objetivo planteado en este trabajo.

El valor estimado de mostró la capacidad del virus para expandirse rápidamente, lo cual fue consistente con estudios previos que indicaron una rápida expansión del chikungunya. La fracción de transmisión de humanos asintomáticos a vectores varió de baja a moderada, lo que podría haber sugerido que esta fracción no desempeñó un papel relevante en la propagación de la enfermedad. La estimación de los parámetros del brote en Acapulco sugirió que la transmisión del virus fue alta tanto de vectores a humanos como de humanos a vectores, lo que indicó un alto riesgo de propagación. El elevado número de picaduras contribuyó a la propagación continua del virus.

Estos resultados subrayan la importancia de implementar medidas de control y prevención contra las picaduras de mosquitos. Para ello, se recomienda eliminar las aguas estancadas, realizar fumigaciones y utilizar mosquiteros en zonas residenciales. De este modo, se puede evitar la reproducción de estos mosquitos, el contagio de la enfermedad y la propagación del virus.

El enfoque Bayesiano ofrece ventajas en el trabajo: permite incorporar información previa mediante distribuciones a priori, lo que mejora la precisión de las estimaciones. Además, facilita la obtención de intervalos de credibilidad, proporcionando no solo valores puntuales, sino también un rango de valores en el cual se encuentra un parámetro con una cierta probabilidad.

BIBLIOGRAFÍA

[1] Agusto, Folashade B and Easley, Shamise and Freeman, Kenneth and Thomas, Madison. (2016) "Mathematical model of three age-structured transmission dynamics of chikungunya virus", Volume 2016. Wiley Online Library. Computational and mathematical methods in medicine 1 4320514

[2] Vu, David M and Jungkind, Donald and LaBeaud, Angelle Desiree. (2017) "Chikungunya virus", Volume 37. Elsevier. Clinics in laboratory medicine 2 371–382

[3] Wahid, Braira and Ali, Amjad and Rafique, Shazia and Idrees, Muhammad. (2017) "Global expansion of chikungunya virus: mapping the 64-year history", Volume 58. Elsevier. International Journal of Infectious Diseases 69–76

[4] Rivera-Ávila, Roberto Carlos. (2014) "Fiebre chikungunya en México: caso confirmado y apuntes para la respuesta epidemiológica", Volume 56. SciELO Public Health. Salud pública de México 4 402–404

[5] Garay-Morán, Carolina and Román-Pedroza, Juan Francisco and López-Martínez, Irma and Rodríguez-Martínez, José Cruz and Ruiz-Matus, Cuitláhuac and Kuri-Morales, Pablo and Díaz-Quiñonez, José Alberto. (2017) "Caracterización clínica y epidemiológica de fiebre Chikungunya en México", Volume 41. SciELO Public Health. Revista Panamericana de Salud Pública e58

[6] Méndez, Nina and Baeza-Herrera, Luis and Ojeda-Baranda, Rafael and Huchim-Lara, Oswaldo and Gómez-Carro, Salvador. (2018) "Perfil clinicoepidemiológico de la infección por Chikungunya en casos hospitalarios atendidos en 2015 en Mérida, México", Volume 41. SciELO Public Health. Revista Panamericana de Salud Pública e91

[7] Simon, Fabrice and Javelle, Emilie and Oliver, Manuela and Leparc-Goffart, Isabelle and Marimoutou, Catherine. (2011) "Chikungunya virus infection", Volume 13. Springer. Current infectious disease reports 218–228

[8] Couturier, Elisabeth and Guillemin, Francis and Mura, Marie and Léon, Lucie and Virion, Jean-Marc and Letort, Marie-José and De Valk, Henriette and Simon, Fabrice and Vaillant, Véronique. (2012) "Impaired quality of life after Chikungunya virus infection: a 2-year follow-up study", Volume 51. Oxford University Press. Rheumatology 7 1315–1322

[9] Staikowsky, Frederik and Le Roux, Karin and Schuffenecker, Isabelle and Laurent, Philippe and Grivard, Philippe and Develay, A and Michault, Alain. (2008) "Retrospective survey of Chikungunya disease in Reunion Island hospital staff", Volume 136. Cambridge University Press. Epidemiology & Infection 2 196–206

[10] de La Cruz-Castro, Ixtac Xochitl and Nava-Aguilera, Elizabeth and Morales-Pérez, Arcadio and Betanzos-Reyes, Ángel Francisco and Flores-Moreno, Miguel and Morales-Nava, Liliana and Balanzar-Martínez, Alejandro and Serrano-de Los Santos, Felipe René and Andersson, Neil. (2020) "Factors associated with chikungunya relapse in Acapulco, Mexico: a cross-sectional study", Volume 20. Mary Ann Liebert, Inc., publishers 140 Huguenot Street, 3rd Floor New …. Vector-Borne and Zoonotic Diseases 10 782–787

[11] Mac, P. A. and Airiohuodion, P. E. and Velayudhan, R. and others. (2023) "Antibody seropositivity and endemicity of chikungunya and Zika viruses in Nigeria", Volume 3. Animal Diseases 7

[12] Vázquez-Peña, María Guadalupe and Vargas-De-León, Cruz and Velázquez-Castro, Jorge. (2024) "Global stability for a mosquito-borne disease model with continuous-time age-structure in the susceptible and relapsed host classes". Submitted to Mathematical Biosciences and Engineering

[13] Vázquez-Peña, María Guadalupe and Vargas-De-León, Cruz and Camacho-Pérez, Jorge Fernando and Velázquez-Castro, Jorge. (2023) "Analysis and Bayesian estimation of a model for Chikungunya dynamics with relapse: An outbreak in Acapulco, Mexico", Volume 20. Mathematical Biosciences and Engineering 10 18123–18145

[14] Korobeinikov, A. (2004) "Lyapunov functions and global properties for SEIR and SEIS epidemic models", Volume 21. Mathematical Medicine and Biology 2 75–83

[15] Korobeinikov, A. (2004) "Global properties of basic virus dynamics models", Volume 66. Bulletin of Mathematical Biology 4 879–883

[16] Vargas-De-León, C. and Castro-Hernández, J. A. (2008) "Local and global stability of host-vector disease models", Volume 25. Foro-Red-Mat: Revista Electrónica de Contenido Matemático 1–9

[17] Vargas-De-León, C. (2012) "Global analysis of a delayed vector-bias model for malaria transmission with incubation period in mosquitoes", Volume 9. Mathematical Biosciences and Engineering 1 165–174

[18] Vargas-De-León, Cruz. (2014) "On the global stability of infectious diseases models with relapse", Volume 9. Abstraction and Application Magazine

[19] Vargas-De-León, Cruz and Esteva, Lourdes and Korobeinikov, Andrei. (2014) "Age-dependency in host-vector models: The global analysis", Volume 243. Elsevier. Applied Mathematics and Computation 969–981

[20] Vargas-De-León, Cruz. (2016) "Global stability properties of age-dependent epidemic models with varying rates of recurrence", Volume 39. Wiley Online Library. Mathematical Methods in the Applied Sciences 8 2057–2064

[21] Van den Driessche, Pauline and Watmough, James. (2002) "Reproduction numbers and sub-threshold endemic equilibria for compartmental models of disease transmission", Volume 180. Elsevier. Mathematical biosciences 1-2 29–48

[22] Abboubakar, Hamadjam and Guidzavaï, Albert Kouchéré and Yangla, Joseph and Damakoa, Irépran and Mouangue, Ruben. (2021) "Mathematical modeling and projections of a vector-borne disease with optimal control strategies: A case study of the Chikungunya in Chad", Volume 150. Elsevier. Chaos, Solitons & Fractals 111197

[23] Dumont, Yves and Chiroleu, Frederic. (2010) "Vector control for the Chikungunya disease", Volume 7. Mathematical Biosciences & Engineering. Mathematical Biosciences & Engineering 2 313–345

[24] Dumont, Yves and Chiroleu, Frédéric and Domerg, Caroline. (2008) "On a temporal model for the Chikungunya disease: modeling, theory and numerics", Volume 213. Elsevier. Mathematical biosciences 1 80–91

[25] Ruiz-Moreno, Diego and Vargas, Irma Sanchez and Olson, Ken E and Harrington, Laura C. (2012) "Modeling dynamic introduction of Chikungunya virus in the United States", Volume 6. Public Library of Science San Francisco, USA. PLoS Neglected Tropical Diseases 11 e1918

[26] González-Parra, Gilberto C and Aranda, Diego F and Chen-Charpentier, Benito and Díaz-Rodríguez, Miguel and Castellanos, Jaime E. (2019) "Mathematical modeling and characterization of the spread of chikungunya in Colombia", Volume 24. MDPI. Mathematical and Computational Applications 1 6

[27] Consejo Nacional de Población. (2022) "Indicadores demográficos de México de 1950 a 2050 (Spanish) [National Population Council, Demographic Indicators of Mexico from 1950 to 2050]"

[28] Gelman, Andrew and Carlin, John B. and Stern, Hal S. and Rubin, Donald B. (1995) "Bayesian Data Analysis". Chapman and Hall/CRC

[29] Kruschke, John K. (2015) "Doing Bayesian Data Analysis: A Tutorial with R, JAGS, and Stan". Academic Press.

[30] Rodríguez-Parra, M. A. and Vargas-De-León, C. and Godinez-Jaimes, F. and Martinez-Lázaro, C. (2023) "Bayesian estimation of parameters in viral dynamics models with antiviral effect of interferons in a cell culture", Volume 20. Mathematical Biosciences and Engineering 11033–11062

[31] Betancourt, Michael. (2017) "A Conceptual Introduction to Hamiltonian Monte Carlo", arXiv

[32] Vehtari, Aki and Gelman, Andrew and Simpson, Daniel and Carpenter, Bob and Bürkner, Paul-Christian. (2021) "Rank-Normalization, Folding, and Localization: An Improved Rˆ for Assessing Convergence of MCMC (with Discussion)", Volume 16. Bayesian Analysis 1–70

[33] Bezanson, Jeff and Edelman, Alan and Karpinski, Stefan and Shah, Viral B. (2017) "Julia: A Fresh Approach to Numerical Computing", Volume 59. SIAM Review 65–98

[34] Ge, He and Xu, Kun and Ghahramani, Zoubin. (2018) "Turing: a language for flexible probabilistic inference". International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. PMLR 1682–1690

[35] Cameron Pfiffer and David Widmann and Martin Trapp and Rob J Goedman and Michael Krabbe Borregaard and Rik Huijzer and Seth Axen and Hong Ge and Kai Xu and dfish and Tor Erlend Fjelde and Andreas Noack and PaulinaMartin96 and Chris Elrod and Jeremiah and Julia TagBot and Matt Karikomi and Hessam Mehr and Xianda Sun and Will Tebbutt. (2024) "TuringLang/MCMCChains.jl: v6.0.6", Volume v6.0.6. Zenodo

[36] Alvarado-Castro, Víctor Manuel and Vargas-De-León, Cruz and Paredes-Solis, Sergio and Li-Martin, Alian and Nava-Aguilera, Elizabeth and Morales-Pérez, Arcadio and Legorreta-Soberanis, José and Sánchez-Gervacio, Belén Madeline and Cockcroft, Anne and Andersson, Neil. (2024) "The influence of gender and temephos exposure on community participation in dengue prevention: a compartmental mathematical model", BMC Infectious Diseases, 24(1)–463.

[37] Gill, Graham V. and Beeching, Nick (2014) "Tropical Medicine: Lecture Notes". Wiley, Oxford, 7th edition

[38] Haider, N. and Vairo, F. and Ippolito, G. and Zumla, A. and Kock, R. A. (2020) "Basic reproduction number of Chikungunya virus transmitted by Aedes mosquitoes", Volume 26. Emerging Infectious Diseases 10 2429–2431

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Published on 19/11/24
Submitted on 09/09/24

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